Pada Dekade tahun 1990-an atas inisiatif para sesepuh yang termasuk Generasi IV Eyang Mertowidjojo (Bp. Sarni Wiharkono Sudarmo/363/Anggota DPRD Kabupaten Sukoharjo dan Bp. Soejono Poerwoatmojo/352/Kepala Desa Pakis, Boto, Wonosari, Kabupaten Klaten), didirikanlah PAGUYUBAN TRAH EYANG MERTOWIDJAYAN (PATREM).
Tujuan utama dari pembentukan organisasi ini yaitu agar anak cucu dan cicit Eyang Mertowidjojo tetap dalam satu wadah keluarga besar. Setidak-tidak melalui wadah ini dapat dijadikan sebagai wahana untuk "Nglumpuke balung pisah, kareben aja nganti kepaten obor". Sekarang Paguyuban Trah Eyang Mertowidjajan diketuai oleh Bapak Agus Sutamtomo/3631, Sekretaris Bapak Drs. Dwi Bambang Putut Setiyadi, M.Hum/3821, sedangkan alamat sekretariat : Wadunggetas RT 06/II, Pakis, Wonosari, Kabupaten Klaten 57473. Email : putut@telkom.net